1969年款车型取消了前门三角窗，对格栅和尾灯进行了小幅修改，并将点火钥匙从仪表板移到了转向柱上（拔出钥匙时会锁住方向盘，这是一项提前一年实施的联邦要求），仪表盘面也从钢蓝色改为黑色。此外，后侧板上的侧标志灯从形状类似庞蒂亚克“箭头”标志的红色透镜，改为形状类似宽大的GTO徽章的样式。1969年生产的所有车型都将前排外侧头枕作为标准配置。
之前的经济型发动机和标准的350马力（260千瓦）400立方英寸（6.6升）V8发动机得以保留，而360马力（270千瓦）的“400 H.O.”则升级为“400 Ram Air”（尽管现在俗称“Ram Air III”，但庞蒂亚克从未使用过这个名称），额定功率为366马力（273千瓦）@ 5,100转/分。顶级选项是Ram Air IV，额定功率为370马力（375 PS；276千瓦）@ 5,500转/分，扭矩为445磅·英尺（603牛·米）@ 3,900转/分，其特点是采用了特殊的类似头段的高流量排气歧管、高流量气缸盖、特定的高升程铝制进气歧管、更大的Rochester Quadrajet四腔化油器、高升程/长持续期凸轮轴，以及各种能够承受更高发动机转速和功率输出的内部部件。与最高转速的Chevy大缸体发动机和Hemi发动机不同，Ram Air IV使用了液压挺杆。
到这个时候，两款Ram Air发动机的毛功率额定值都非常可疑，与实际产生的功率关系不大，更多是与通用汽车内部的一项政策有关，该政策限制除Corvette外的所有车型，其广告马力不得超过每10磅（4.5千克）整备重量对应1马力。更高转速的Ram Air IV的广告功率峰值被列为5,000转/分——比功率较低的Ram Air 400低了100转/分。
一款名为“The Judge”的新车型被推出。这个名字来源于喜剧桥段“Here Come de Judge”，该桥段在Rowan & Martin的Laugh-In电视节目中反复使用。由喜剧演员Flip Wilson推广开来的The Judge桥段，借鉴了长期从事滑稽戏表演的艺人Dewey "Pigmeat" Markham的表演。广告使用了诸如“全体起立，法官驾到”和“法官可以被收买”等口号。摇滚乐队Paul Revere & The Raiders也录制了一首特别的歌曲来为The Judge做广告，并出现在电视宣传中。最初设想时，The Judge是一款低成本的GTO，剥离了一些功能以使其与Plymouth Road Runner竞争。该套件比标准GTO贵332美元，包括Ram Air 400发动机、不带装饰环的Rally II轮毂、Hurst换挡杆（带有独特的T形手柄）、更宽的轮胎、各种贴花和一个后扰流板。庞蒂亚克声称该扰流板在高速时有一定功能效果，能产生虽小但可测量的下压力，但在法定速度下价值不大。The Judge最初仅提供Carousel Red颜色，但在该车型年中期开始提供其他颜色。
GTO的销量被Chevrolet Chevelle SS396和Plymouth Road Runner超越，但在1969车型年仍售出了72,287辆，其中6,833辆配备了The Judge套件。
