GF-BNR34（R34）Skyline GT-R、GT-R V·spec及GT-R V·spec N1车型于1999年1月8日推出。与前代车型相比，R34 GT-R的车身长度（从前到后）更短，前悬也有所缩短。其气门室盖被漆成亮红色（颜色代码Cherry Red Effect Z24或X1020），[需要引用]这与之前车型的黑色形成对比。
R34 GT-R的一项新功能是仪表板中央的5.8英寸LCD多功能显示屏，可实时显示七种不同的发动机和车辆统计数据，例如涡轮增压器压力（最大1.2 bar）、机油和水温等。GT-R V·spec车型为显示屏增加了两项额外功能：进气和排气温度。Nismo多功能显示屏（MFD）可额外购买，它们包括圈速计时器、G力计以及将增压压力测量范围提升至2 bar。R34 GT-R的车身缩短是针对客户认为R33过于庞大的担忧而做出的回应。
与R33一样，新款R34 GT-R V·spec（Victory Specification）车型配备了ATTESA E-TS Pro系统和后部主动限滑差速器，而标准GT-R车型则配备非Pro系统和传统机械差速器。V·spec车型还拥有更硬的悬挂和更低的离地间隙，这得益于前部和侧部分流器，以及一个后部碳纤维空气扩散器，旨在保持气流在车底平稳通过。
在R34推出时，与R32和R33一样，日产推出了R34 V·spec N1车型。R34 V·spec N1的配置类似于R32和R33 N1车型——一款认证特别版。它在销售时不配备空调、音响设备、后雨刷或行李箱衬里，但保留了ABS。新款R34 N1也配备了新的R34 N1发动机。已知工厂仅生产了38台R34 V·spec N1车型，其中12台被Nismo用于Super Taikyu赛事。其余车辆销售给了不同的客户，主要是赛车队和改装厂。
V·spec版本也通过Middlehurst Nissan经销商进口到英国，这80辆车进行了一系列改装。这些改装包括3个额外的机油冷却器、修订的ECU映射、全套Connolly真皮内饰、底部扩散器、更硬的悬挂、主动后限滑差速器、提高至250 km/h（155 mph）的限速器以及车载显示屏上的额外显示功能。除了英国，还有10辆销往香港和新加坡，5辆销往新西兰，但针对各自市场进行了不同的改动。
2000年10月，日产推出了V·spec II，取代了V·spec。V·spec II的悬挂刚度增加（甚至比原版V·spec更硬），并配备了更大的后刹车盘。它还配备了带有NACA进气口的碳纤维引擎盖，比所有其他GT-R引擎盖所用的铝材更轻。V·spec II的不同之处还包括铱金中控台和铝制踏板。座椅采用黑色布料包裹，而非之前R34 GT-R车型使用的灰色布料，琥珀色转向灯透镜也被白色版本取代。
除了碳纤维引擎盖外，标准配置级别的GT-R也获得了这些更新。总共生产了18台V·spec II N1。日本共生产了1855台V·spec II，另有2台销往新西兰市场。V·spec N1被V·spec II N1取代。应用于V·spec N1的相同改动也应用于V·spec II N1，但V·spec II的碳纤维引擎盖现在是未上漆的。
2001年5月，M·spec推出。它基于V-spec II，但配备了特殊的“Ripple control”减震器、修订的悬挂设置、更硬的后防倾杆以及带有加热前排座椅的真皮内饰。M·spec中的“M”代表日产首席工程师Mizuno。唯一其他的变化是移除了碳纤维引擎盖，代之以标准铝制引擎盖。
2002年2月，日产推出了R34 GT-R的最终量产车型，名为Skyline GT-R V·spec II Nür和Skyline GT-R M·spec Nür，它们基于V-spec II N1。Nür以著名的德国Nürburgring赛道命名，Skyline正是在此赛道上进行开发的。
日本总共生产了1,003台R34 GT-R Nür。其中718台是V·spec II Nür，285台是M·spec Nür。Nür车型采用了基于N1赛车发动机改进的RB26DETT。标准涡轮增压器升级为更大的版本，增压略有提升，陶瓷叶片被钢制版本取代。这增加了涡轮迟滞，但提高了涡轮的耐久性，同时能够承受更大的增压提升。V·spec II Nür基于常规V·spec II车型，而M·spec Nür基于常规M·spec车型。
除了增加Nür发动机外，Nür车型还包括内饰缝线颜色不同、最高时速达300 km/h（186 mph）的里程表、金色气门室盖（取代红色）以及金色VIN板（取代银色）。由于当时日本乘用车行业的规范，该车广告标称功率为206 kW（280 PS；276 hp），但其实际出厂功率超过246 kW（334 PS；330 hp）。
1999年，在日产于Nürburgring Nordscheleife的测试期间，该车由日产试车手Kazuo Shimizu驾驶，创下了7分52秒的非官方圈速纪录。该车打破了Skyline GT-R R33的纪录，后者曾是该赛道上最快的量产车。
Nismo最初在2000年左右设计了Z-tune的概念，当时日产即将结束R34 Skyline的生产。它于2000年Nismo Festival首次公开亮相，旨在提出一款真正的计时赛机器。它配备了一台概念性的RB26DETT 'Z1'发动机。这台发动机基于日产在勒芒GT2和GT500赛事中的经验。与赛车一样，它使用了强化的发动机缸体和加长的曲轴。发动机缸径也进行了扩大。凭借新的2.8升排量和升级的涡轮增压器，Z1发动机在7600 rpm时输出441 kW（600 PS；591 hp）的功率，在5200 rpm时输出647 N⋅m（477 lbf⋅ft）的扭矩。这台Z-tune 'Z1'原型车赢得了2000年Nismo Festival的'Tuners' Battle'，它是专门为富士赛道规格制造的。重点在于发动机，外观改装包括Nismo S-tune前保险杠、新的碳纤维Nismo引擎盖以及Nismo贴花和赞助商标志。
Nismo迅速继续开发这款车，但采用了更偏向公路的方案，注重舒适性和更豪华的内饰。发动机进行了第二次修订，称为'Z2'，为了通过排放法规，其功率被调低至368 kW（500 PS；493 hp），扭矩为540 N⋅m（398 lbf⋅ft）。这台2.8升发动机经过修订，使其转速可达8,000 rpm，涡轮增压器由日本的IHI提供，但发动机的主要重点是响应时间。该车还配备了新的Nismo侧裙和后裙，以获得更好的空气动力学性能。为了充分测试发动机并确保其可靠性，日产与Falken合作，从2001年到2005年，让一辆配备'Z2'发动机的R34 GT-R参加了Nürburgring 24小时耐力赛。这款偏向公路的'Z2'原型车也于2003年在Nürburgring进行了测试。
随后，日产批准Nismo为Nismo 20周年纪念生产Z-tune车型，此时距离R34停产已有18个月。Nismo随后购买了18辆二手R34 GT-R，每辆里程表均低于30,000 km（18,500英里），车况完好且无事故历史。整辆车基本上是手工打造的，车辆被完全拆解并从头开始重新组装。18辆量产车中的每一辆都配备了如今坚固可靠的'Z2'发动机，其在6800 rpm时输出368 kW（500 PS；493 hp）的功率，在5200 rpm时输出540 N⋅m（398 lbf⋅ft）的扭矩。Nismo声称Z-tune的0–100 km/h（0–62 mph）加速时间为3.8秒，最高时速超过327 km/h（203 mph），402米（1/4英里）加速时间为10.06秒。
Z-tune还通过Sachs提供的激进悬挂设置和专门设计的Brembo制动系统进行了改进。工程师们在关键区域（如车门接缝和门框）加强并硬化了底盘接缝焊接，并在支柱塔、传动通道和发动机舱增加了碳纤维，完全重新设计了悬挂、传动系统、发动机、变速箱和其他部件，以使其达到公路车辆所期望的最大效率和可靠性。
Z-tune的最终车身设计采用了新的专属碳纤维部件，包括特定的前保险杠、受Falken R34 GT-R启发的特定前翼子板和后翼子板延伸件。最终车型保留了Nismo LM GT4轮毂、碳纤维引擎盖以及2002年原型车的Nismo空气动力学部件。
尽管Nismo计划生产20辆车，但最终仅生产了19辆，包括原型车和两辆保留车。17辆车被重新喷涂为“Z-tune Silver”，这是Z-tune专属的特殊颜色，另外两辆车保留了原始颜色。第一辆基于V·spec，颜色为Midnight Purple III（底盘号R34-Z-010），其原V·spec车主花了大约1年时间说服Nismo不要将其重新喷涂为“Z-tune Silver”。第二辆基于M-Spec Nür，颜色为Millennium Jade（底盘号未知）。一辆Z-tune（底盘号R34-Z-015）在Omori Factory进行了全面修复，并从经典的“Z-tune Silver”重新喷涂为Midnight Purple III颜色。
2002年R34停产之后，日产宣布将GT-R车型与Skyline名称分离，创造一款全新的车辆——尽管基于与Skyline相似的平台。这款后续车型，简称为Nissan GT-R，于2007年在东京首次亮相。2008年向消费者推出，它是首款在全球范围内销售的GT-R，首次进入北美市场。
GT-R采用了Premium Midship（PM）平台，这是FM平台的演进，该平台最初用于V35世代的Skyline。Skyline GT-R的传统体现在其底盘代码中：CBA-R35（2007–2011）、DBA-R35（2012–2016）、4BA-R35（2017–2025）或简称为R35。
