第三代 Lincoln Town Car 于 1998 年款发布，在 1997 年纽约国际车展上首次亮相。除了对悬架和制动系统进行大规模修订外，所有三款 Panther 平台轿车的内外饰都进行了重大更新；Town Car 采用了全新的车身设计。值得注意的是，Lincoln 几乎与 Lincoln Navigator 全尺寸 SUV 同时推出了第三代 Town Car，使其跻身 Lincoln 车型系列的顶端。
与 Town Car 的重新设计和 Navigator 的推出相吻合，Lincoln-Mercury 成为 Premier Automotive Group 的美国品牌，这是 Ford 为管理其在 1990 年代收购的高端品牌而创建的一个部门。在经历组织困难（导致 Lincoln 在 2000 年之前销量落后于 Cadillac）之后，Lincoln-Mercury 于 2002 年恢复了其先前的部门结构。
作为 The Way Forward 计划的一部分，Wixom 装配厂（自 1958 年以来除 Versailles、Blackwood、Aviator 和 Navigator 外所有 Lincoln 车型的生产地）计划在 2007 年生产结束后关闭，这最初使 Town Car 的未来面临风险。2008 年，生产转移至 Ford Canada，与 Ford Crown Victoria 和 Mercury Grand Marquis 一起迁至 St. Thomas 装配厂。
1998 年，Panther 底盘回归，并对悬架和制动系统进行了多项升级。为了提升制动性能，增加了双活塞前制动卡钳以及更大的制动盘（这要求将 16 英寸车轮从驾驶员侧翼子板内衬移至发动机前部）。在非礼宾车车型上，四轮盘式制动器是标准配置；礼宾车则配备了后鼓式制动器。尽管前悬架的基本部件保持不变，但其安装硬件经过重新设计，以改善行驶和操控特性。实心后桥悬架进一步增加了 Watt's Linkage 以提升方向控制。
2003 年，该平台经历了自 1979 年推出以来最大规模的更新，车架进行了彻底重新设计。为了提升底盘刚性（近 25%），车架纵梁采用了液压成型并全程封闭。转向系统升级为速度感应式齿轮齿条设计；该设计在减轻重量和降低维修复杂性的同时，提升了转向精度。为了进一步改善行驶质感，多个悬架部件进行了更换，包括铝制前下控制臂、新型前上控制臂、更新的转向节以及螺旋弹簧减震器一体式前减震器。虽然保留了实心后桥，但后减震器被移至车架纵梁外侧。为了提升制动性能，配备了更安静的 EBD 制动助力器并带有机械式紧急辅助功能，优化了前后制动分配；Town Car 还换装了具有高正偏距的 17 英寸车轮（平直面车轮）。
第三代 Town Car 沿用了上一代的 4.6L SOHC 16 气门 V8 发动机。再次提供两种配置，发动机经过重新调校，输出功率分别为 205 hp（单排气）和 220 hp（双排气）。在功能上，之前使用的线圈组被线圈对火花塞点火系统取代。V8 发动机引入了故障安全冷却系统，包括一个双速电子散热器风扇。作为重新设计的一部分，多个发动机和底盘部件的位置发生了变化，冷却液储液罐从乘客侧翼子板内衬移至散热器风扇护罩上；动力转向储液罐从驾驶员侧翼子板内衬移至发动机前部。2001 年款，4.6L V8 发动机采用了“Performance Improved”（PI）气缸盖，将马力提升至 220 hp（单排气）和 235 hp（双排气）。
与上一代一样，Town Car（以及所有其他 Panther 底盘车辆）使用了 4R70W 4 速自动变速箱。
作为 2003 年修订的一部分，双排气版本的 4.6L V8 发动机成为 Town Car 的标准配置，重新调校至 239 hp（与 Crown Victoria Police Interceptor 共享，以及其数值更高的 3.27:1 后桥主减速比）。为了减少噪音问题，排气系统吊架被移至车架纵梁上。V8 发动机进行了几项功能性更改，机油容量扩大至 6 夸脱；可变转速冷却风扇取代了之前的双速风扇。为了提升排放性能，EGR 系统进行了更新，燃油系统变为无回油式。发动机顶部增加了一个新的发动机罩；护罩现在成为动力转向储液罐的安装点（之前用螺栓固定在发动机上）；机油加注口盖在发动机上交换了位置，发动机舱内的保险丝盒也交换了位置。2005 年，发动机配备了电子节气门控制，将巡航控制功能移至发动机电脑；变速箱增加了进一步的电子控制（更名为 4R70E）。28 花键半轴被改进的 31 花键单元取代；作为一项小改动，Town Car 配备了加热式 PCV 阀。变速箱在 2006 年进行了进一步的内部修订，成为 4R75E。
所有 Town Car 在 2009 年都获得了 Flex Fuel 能力，使其能够使用 E85、汽油或两者的任何混合物运行。
与 Ford Crown Victoria（采用了更新版 Mercury Grand Marquis 的大部分车身）的外观重新设计形成对比，1998 年的 Town Car 采用了全新的车身和内饰进行重新设计，与其前代车型或同门车型均无共同之处。
比其 1997 年的前代车型短三英寸，1998 年的 Town Car 宽度增加了两英寸，高度增加了一英寸（成为 40 年来最高的 Lincoln 轿车）。打破了自 1960 年代初以来 Lincoln 轿车使用的直线造型风格，新的外观采用了更流畅、更圆润的设计；在保留传统设计元素的同时，Town Car 还从 Mark VIII 和 1995 年重新设计的 Continental 中汲取了许多造型元素。散热器格栅被重新塑造成椭圆形，其瀑布式设计与 Lincoln Navigator 共享（引擎盖立标被取消）。与较小的 Continental 类似，第三代 Town Car 从六窗车顶线变为四窗车顶线，上一代近乎垂直的后窗在其轮廓上采用了轻微的曲线。与 1997 年相反，“Town Car”徽章重新出现在前翼子板上，装饰徽章则回到 C 柱上。虽然形状有所改变，但独立的尾灯设计特征得以保留（带有居中的 Lincoln 星徽标志）；它们之间的填充面板被取消，取而代之的是一个大的镀铬环绕（牌照架从后保险杠移至行李箱盖）。
2001 年，Lincoln 推出了加长轴距版 Town Car L（见下文）。为了降低成本，2001–2002 年版本通过加宽 B 柱车门钣金来加长后门（保留量产车门玻璃）进行生产。
2003 年 Town Car 的重新设计带来了广泛但渐进的外观变化。为了使设计更接近当代 Lincoln 车型，下部车身变得方正，前脸按照 Lincoln LS 的风格重新设计。虽然格栅集成到了发动机盖中，但引擎盖立标（在缺席 5 年后）重新回归。在几项徽章变化中，Town Car 徽章从前翼子板上移除，Lincoln 星徽标志从尾灯上删除；Town Car 徽章回到了行李箱盖上（自 1997 年以来首次）。标准轴距 Town Car 保留了相同的车顶线，而 Town Car L 则获得了重新设计的后门（带有更大的三角窗）。根据装饰级别，几款 Town Car 车型用高强度/HID 大灯取代了卤素大灯。
在 2003 年重新设计之后，Town Car 的外观变化很少。2007 年，该车型系列采用了重新设计的车轮。随着生产的转移，从 2008 年起，Town Car 提供两种车轮设计（而非四种）。
与其前代车型一样，第三代 Town Car 与其同门车型共享的可见通用部件很少，主要例外是转向柱和收音机控制装置。使用了二十多年的 50/50 分体式长条座椅配置被 40/20/40 设计取代；为了更好地容纳第三名前排乘客，中间部分被固定。数字仪表盘被淘汰，转而采用模拟系统（主要集成了上一代的数字行车电脑）。
1999 年，Town Car 将座椅安装式侧安全气囊作为标准配置。标准配置的 Executive Series 恢复了几项之前被取消的功能，包括后排座椅中央扶手和门板电动座椅控制装置（1998 年在 Signature 和 Cartier 装饰上引入）。上一代的车载电话被便携式 Motorola Timeport 电话取代，引入了语音识别功能；作为对 GM 推出的 OnStar 系统的回应，Town Car 采用了 Continental 引入的 RESCU 远程信息处理系统，包括一个带有自己麦克风的后视镜，增加了 SOS 和道路救援按钮；Rescu 系统在 2003 年款之后被停产。取代伸缩式转向柱，Town Car 在 2001 年引入了电动可调制动/油门踏板。
与 2003 年的车身和底盘更新一致，Town Car 的内饰也进行了功能性更改。虽然仪表板设计大部分保持不变（镀铬件大多被缎面金属饰面取代），但中控台进行了一系列更新。虽然仍使用双 DIN 主机，但收音机和空调控制装置经过重新设计并重新定位（以占用更少空间）；之前仅在 Cartier 装饰上提供的模拟时钟现在成为标准配置（从中央移至顶部）。为了增加储物空间，前排杯架从烟灰缸中移除，并移至前排中央座椅的底部。除了重新设计的座椅面料外，外侧前排座椅配备了更大的头枕。在所有装饰级别上，后驻车传感器成为标准配置；在 Cartier 装饰上提供了电动行李箱盖。为了降低生产成本，前排座椅上的储物袋作为运行中的更改被取消。
2004 年，几项功能进行了更新。作为旗舰选项，引入了触摸屏导航系统，将 6 碟 CD 换碟机集成到收音机单元中（行李箱安装的换碟机也仍作为选装件）；Sirius 卫星广播作为独立选装件添加。虽然之前的集成蜂窝电话被淘汰，但该系统被可选的蓝牙连接取代，允许驾驶员使用手机并专心驾驶。2005 年，内饰进行了进一步的功能性更改，卫星导航系统升级为 THX 音频处理（与 Lincoln LS 共享的选项）。仪表盘发生了明显变化，Town Car 配备了新的转向柱（与 Mercury Grand Marquis 共享，采用木纹方向盘）。乘客安全气囊的钥匙锁止功能被取消（功能上被前排乘客座椅上的重量传感器取代）。2006 年，仪表组进行了彻底重新设计（自 1998 年以来首次），首次为 Town Car 增加了转速表，将先前设计的两个数字功能合并为一个。
随着装配业务迁至 St. Thomas，Town Car 在 2008 年经历了几项功能变化。基于 DVD 的 THX 卫星导航系统被淘汰（与之共享的 Lincoln LS 在 2006 年后停产）；随着盒式磁带的使用减少，双媒体立体声音响也被停产。取而代之的是，该车型系列标配了带有 6 碟内嵌式 CD 换碟机的 9 扬声器 Audiophile 系统。2009 年，联邦安全法规要求重新设计车窗开关；随后，2011 年引入了更新的头枕。2011 年，随着该车型系列供应结束，一些车辆开始配备缺少双向储物格的前排扶手。
第三代 Lincoln Town Car 最初提供四种装饰级别：Executive Series、Signature Series、Signature Series Touring Sedan 和 Cartier；在 2011 年生产结束前，装饰级别进行了多次重组。
基础版 Executive Series 提供标准后空气悬架、Lincoln 的 SecuriLock 防盗系统、Lincoln 的 SmartLock 防锁系统、自动大灯、加热后视镜、全速牵引力控制、带有 Lincoln“Tripminder”的电子信息中心、防抱死制动系统、带 8 向电动驾驶员座椅/6 向电动乘客座椅的皮革座椅（1998 年可选织物座椅，1999 年前排乘客座椅变为 8 向电动）、带巡航控制功能的皮革包裹方向盘、带四个扬声器的“Premium Sound”AM/FM/卡带立体声音响、电子自动温度控制（EATC）、座椅安装式侧安全气囊（1999 年及更新车型）以及 16 英寸“Gear Tooth”铝合金车轮。
中档 Signature Series 增加了 JBL（仅 1998 年，1999–2003 年为 Alpine）AM/FM/卡带立体声音响、驾驶员座椅和后视镜的双驾驶员记忆功能、电子自动防眩目后视镜、前排乘客腰部支撑功能、带冗余音频/温度控制的方向盘以及 16 英寸“Snowflake”铝合金车轮。可用选装件包括加热前排座椅、带数字信号处理的 9 扬声器 145 瓦音响系统、自动防眩目驾驶员侧后视镜、电动天窗、六碟 CD 换碟机、木纹方向盘、集成蜂窝电话、双色车漆以及 Premium Package，该套件将上述几个选装件整合为一个选装包。
从 1998 年到 2002 年，Signature Series Touring Sedan 的定位高于 Signature Series。为了吸引寻求更具运动感功能的年轻买家，它是 Lincoln 对应 Crown Victoria 和 Grand Marquis 上提供的 Handling and Performance Package 的版本。Touring Sedan 车型配备了 3.55:1 的后桥主减速比以提升加速性能，更高失速点的 11.25 英寸液力变矩器，双排气，重新调校的悬架部件（带有更大的稳定杆和运动调校转向），独特的穿孔皮革座椅，黑色鸟眼枫木内饰饰条，银色格栅，单色车身侧面饰条以及更宽的 16 英寸“Chrome-Tech”车轮配运动轮胎。除双色车漆外，所有可用选装件均与 Signature Series 共享。
顶级装饰 Cartier 增加了 Cartier 专属的皮革座椅饰面；座椅靠背上绣有 Cartier 标志，并采用独特的座椅面料。内饰门拉带（1998–2002 年）和脚垫上也带有 Cartier 徽章。此外，在仪表板中央、空调控制装置上方放置了一个模拟“Cartier Clock”。而且，加热前排座椅是标准配置。Cartier 专属特征也延续到外观，包括黑色的“Lincoln Star”前脸徽章和行李箱盖上的黑色 Cartier 徽章。此外，Cartier 配备了 16 英寸“Cartier”镀铬车轮。与 Signature Touring Sedan 一样，双排气是标准配置。Cartier 与 Signature Series 共享了几个独立选装件，甚至提供相同的 Premium Package 作为选装。最后，Gold Package 作为可选装备提供；其特点是金色外观徽章。
2001 年，随着一款六英寸加长轴距版 Town Car 的推出，装饰级别得以扩展，该车型面向礼宾车和豪华轿车服务市场。为了适应加长轴距，B 柱被加宽；这样做也是为了便于使用标准轴距版本的相同后门玻璃。它提供 Executive 和 Cartier 两种版本（命名为 Executive L 和 Cartier L）。据 Lincoln 称，加长轴距提供了额外的 7.8 立方英尺的乘客空间。此外，Cartier L 配备了后排照明化妆镜、加热后排座椅、4 向可调后排头枕以及一个中央扶手，该扶手带有收音机、空调控制装置和前排乘客座椅导轨的冗余控制，以提供更多腿部空间。
2002 年，Premium Package（包括天窗和六碟 CD 换碟机）成为一个独立的装饰级别，其定位高于其所基于的各个相应装饰（Premium Signature Series、Premium Signature Touring Sedan 和 Premium Cartier）；它不适用于 Executive Series 或加长轴距版本。
在 2003 年的更新中，Signature Series Touring Sedan 从产品线中移除。Executive 和 Signature 的“Series”后缀也被取消（在 2004 年的销售手册中）。此外，长轴距版 Executive L 仅限于车队销售。
2004 年，装饰阵容进行了几项更改。所有 Premium 装饰均被取消，标准轴距版 Executive 仅限于车队销售。此外，所有版本的 Cartier 均被停产；它们被新的顶级装饰 Ultimate / Ultimate L 取代。Ultimate 装饰是短命的，在 2005 年被停产。
2005 年，装饰级别再次重组，Town Car 现在为零售销售提供三种装饰级别：Signature、Signature L 和 Signature Limited。作为 Ultimate L 的替代品，Signature L 配备了相同的“Rear Seats Amenities Package”；它包括加热后排座椅、4 向后排乘客头枕、带纸巾盒的双后杯架、后排照明化妆镜以及一个中央扶手，该扶手带有收音机、空调控制装置和前排乘客座椅导轨的冗余控制，以提供更多腿部空间。与其仅限车队销售的 Executive L 对应车型相比，Signature L 提供了加热前后排座椅、木纹方向盘以及基于 DVD 的卫星导航系统（直到 2008 年）。
新的顶级装饰 Signature Limited 包括一个带有数字信号处理的 Soundmark Audiophile 双媒体 AM/FM/CD/卡带收音机、8 个扬声器、一个低音炮和一个 150 瓦放大器；加热前排座椅；带记忆功能的电动可调踏板；方便进出的驾驶员座椅；全电动行李箱盖；电动天窗；以及木纹方向盘。Signature Limited 的可用选装件包括 HID 大灯、带卫星导航的 THX 认证音响系统、电动天窗、行李箱整理器、17 英寸凹槽铝合金车轮和双色车漆；所有可选装备（天窗除外）均与 Signature L 共享。
2006 年，引入了 Designer 系列装饰，其定位高于 Signature Limited，成为新的旗舰 Town Car。Designer 车型包括 Provence 皮革内饰搭配双色门板、可调后排头枕、拉丝铝制门槛饰板、额外的镀铬外观饰条以及 17 英寸 18 辐镀铬铝合金车轮。
随着装配厂的转移，2008 年，基础版 Signature 和顶级装饰 Designer 被永久停产，留下 Signature Limited 和加长轴距版 Signature L 作为零售销售的唯一剩余车型，直至 2011 年生产结束；仅限车队的 Executive 和 Executive L 也将持续到 2011 年。此外，许多可用选装件被标准化或直接取消，仅留下 HID 大灯、日间行车灯、白壁轮胎、17 英寸 18 辐镀铬铝合金车轮和行李箱整理器作为仅存的选装件。
Limited Edition 从 2003 年到 2004 年，Lincoln 为 Ultimate 装饰提供了 Limited Edition 套件；它在 C 柱上带有 Limited 徽章、雾灯、加热和记忆座椅，以及轮辋和格栅上的 Arden 嵌件。2005 年，Limited Package 现在在 Signature Limited 上提供，带有双色车漆方案（以及双色座椅）；雾灯也从该套件中移除。
Pro Series 2004 年提供，在 C 柱上放置了一个特殊的 Pro-series 徽章；背景为高尔夫球场。该徽章绣在前排座椅上，此外还有镀铬 9 辐轮辋和双色配色方案。
25th Anniversary Edition Lincoln 通过在 2006 年 Signature Limited 上提供 25th Anniversary Edition 套件来纪念 Town Car 诞生 25 周年。该套件包括镀铬 B 柱和门把手、独特的桉木饰板及配套的木纹镶嵌方向盘、带有“25th Anniversary Edition”和“25th-anniversary”徽章的门槛饰板、Provence 皮革独立 40/20/40 休闲座椅（带独立舒适功能、褶裥、对比色滚边和可调后排头枕）、雾灯和 9 辐镀铬车轮。
Continental Edition 2010–11 年提供的是 Continental Edition 套件；仅作为 Signature Limited 装饰的选装件提供。该套件增加了 Continental 徽章、镀铬 17 英寸车轮以及 B 柱上的装饰。在内饰方面，Continental 名称绣在前排座椅和前排脚垫上。
Lincoln Town Car 是世界上第一款在每个类别中都获得美国五星级碰撞评级的生产型轿车。
美国国家公路交通安全管理局（NHTSA）2003 年 Lincoln Town Car 碰撞测试评级（带侧安全气囊）
美国国家公路交通安全管理局（NHTSA）1998 年* Lincoln Town Car 碰撞测试评级（带侧安全气囊）
