1997年，Ford Econoline 进行了外观和内饰的全面更新，主要是使其外观与其他 Ford 卡车保持一致。之前的蛋格状格栅被一个八孔椭圆形开口取代（与 Explorer 和 F-150 相匹配）。1999年，Econoline 更名为 E-Series，采用了与 F-Series 系列类似的命名方案，包括 E-150、E-250 和 E-350，而 E-Super Duty 则成为 E-450。
内饰进行了彻底重新设计，采用了全新的仪表板。在配备双安全气囊（所有版本）后，“砖块”式方向盘被一个带有中央喇叭按钮的方向盘取代。为了提高内饰控制的便利性，引入了旋转式气候控制开关以及双 DIN 收音机。仪表板经过重新设计，重新引入了模拟里程表。前排座椅也进行了重新设计，将安全带安装点移至 B 柱。
2001年9月，Ford 宣布正在开发用于切割式车身的 E-Series E-550 版本。2002年，Ford 推出了 E-550 Super Duty，作为 E-Series 中总车辆重量评级（GVWR）最高的版本，GVWR 高达 19,000 磅。E-550 仅提供切割式驾驶室设计，旨在填补基于皮卡的 F-450/550 Super Duty 与 F-650 中型卡车之间的空白。
E-550 与 F-550 Super Duty 共享许多底盘部件，其特点是格栅设计风格与 Super Duty 皮卡一致（在两个垂直开口之间有三个水平槽）。为了适应更宽、更重载的前轴，厢式车车身配备了更大的前保险杠和塑料挡泥板轮眉（与 F-550 卡车共享）。提供多种轴距选择，范围在 159.5 英寸至 233.5 英寸之间；与 Super Duty 和 E-350/450 一样，E-550 搭载 6.8L V10 或 7.3L V8 涡轮增压柴油发动机。
在 2003 车型年之后，Ford 停止了 E-550 的生产。
