9-3X概念车作为下一代9-3的预览，于2002年1月在北美国际车展上首次亮相。最初，9-3计划于2001年10月在法兰克福车展上与Opel Vectra一同首发，但2001年7月宣布，由于延误迫使通用汽车推迟了发布。新款9-3最终于2002年7月上市，对应2003款车型年。第二代9-3的敞篷版始于MY04，SportCombi版始于MY06。
新款9-3在发布时仍为纯前轮驱动动力系统。与上一代车型相比，最显著的美学变化是取消了掀背设计。第二代9-3提供四门轿车、旅行车（于2005年底作为2006款车型推出，根据市场不同称为SportWagon、SportCombi或Sport-Hatch）以及双门敞篷车（2004年推出）。它配备了Saab主动头枕（SAHR II）以减少颈部扭伤，以及ReAxs，这是一种后悬挂衬套特性，通过改变束角来帮助减少重刹车时的转向不足。
新款9-3放弃了之前使用的Saab H / EcoPower发动机，转而采用通用汽车的新型2.0升直列四缸Ecotec发动机用于汽油车型。涡轮增压直列四缸发动机有三种不同版本，涡轮增压值决定了功率输出：1.8t（112千瓦）、2.0t（131千瓦）和2.0T（157千瓦）。发动机匹配5速手动变速箱或5速'Sentronic'传统自动变速箱，不要与Saab早期的'Sensonic'混淆，后者是一种无离合器手动变速箱，保留了传统的H型换挡杆，但离合器系统是液压操作的。在2003款车型中，标准手动变速箱是5速，6速为选配。6速手动变速箱是美国2.0T（Vector）车型的标准配置。
有四个配置级别：入门级Linear、中端Vector和Arc（强调运动感和豪华感），以及顶级的Aero车型。在非美国市场，除了Aero（仅提供210马力2.0T发动机）外，任何配置级别均可搭配买家选择的任何发动机。然而，在美国，Linear仅提供2.0t发动机，Arc和Vector配置仅提供2.0T，而Aero车型提供更多选项，如天窗、更大的车轮和6速手动变速箱，同时保留与2.0T相同的B207R发动机。它将在2006年配备2.8升涡轮增压V6发动机。美国没有销售柴油车型，也没有1.8T或任何BioPower发动机。
9-3和Opel Vectra是通用汽车全球Epsilon平台的首批车型，该平台随后被加长以容纳四款新衍生车型：Chevrolet Malibu/Malibu Maxx、Pontiac G6和Saturn Aura。专有的光纤电气/电子系统、全轮驱动的可能性（从2008年起采用，称为Saab XWD）以及ReAxs是9-3独有的特性。
2012年2月22日，最后47辆Saab汽车下线。所有这些车都是9-3敞篷车，其中37辆是'Independence Edition'敞篷车型，全部由瑞典最大的汽车经销商之一ANA在Trollhättan组装。在组装的47辆车中，21辆为左舵，26辆为右舵。最后一辆Saab是Saab 9-3 Aero Independence Edition TTiD敞篷车。
在美国，Vector配置级别被Aero取代。Arc配置级别用五速手动变速箱取代了六速。在英国，9-3 Aero 2.0T提供了六速手动变速箱。
2.2 TiD发动机被来自Fiat的共轨1.9 TiD发动机取代。1.9 TiD提供8气门版本（120马力）和16气门版本（150马力）。8V版本仅提供6速手动变速箱，而16V版本也提供6速自动变速箱。16V版本标配柴油颗粒过滤器，而8V版本在2005款车型年为选配。与2.2 TiD一样，1.9 TiD在美国没有销售。
美国版本标配16英寸车轮（Aero为17英寸），而之前Linear版本配备的是15英寸车轮。在美国，但不在大多数国家，2005年是Linear和Arc版本的最后一年。此外，6速手动变速箱被取消，Arc和Aero都配备了5速手动变速箱。
一款新的2.8升涡轮增压V6发动机，被Saab品牌称为2.8T，为Aero引入。2006年Aero在美国仅提供V6版本，取代了2.0T发动机。在其他市场，2006年Aero提供四缸2.0T和六缸2.8T发动机。2.0T的最大涡轮增压压力为12.3 psi，产生210马力（157千瓦），而2.8T的增压压力为8.7 psi，产生250马力（186千瓦）。在某些市场，如瑞士，Vector配置也提供230马力的六缸变体。[需要引用]
在美国，Linear车型和175马力发动机被取消，因此所有四缸9-3车型都使用210马力发动机。Arc名称被取消，取而代之的是名为2.0T的配置级别，类似于2005年Arc，但使用Linear车轮。为庆祝Saab 900敞篷车推出20周年，一款面向美国市场的'20 Years Edition Aero Convertible'于2006年1月在洛杉矶车展上揭幕。所有这些车型均采用金属电蓝色涂装。
仪表板在2007年进行了改进，Saab信息显示屏从高位移至主仪表组。按钮繁多的气候控制系统被取消，取而代之的是Saab 9-5系统，OnStar重新引入，并在北美订购导航时成为必需，通用汽车公司主机首次亮相，支持卫星广播和MP3 CD功能。钢灰色也被钛灰色取代作为外观颜色选择。对于2007款车型年，9-3还提供1.8t和2.0t发动机的Biopower版本，能够使用E85和汽油运行。
在美国市场，仅提供210马力2.0升16气门涡轮发动机和250马力2.8升V6涡轮发动机。2.0T车型的手动变速箱从5速改为6速。
2007年还为轿车、旅行车和敞篷车型提供了60周年纪念版，以庆祝SAAB成立60周年。该套件适用于2.0T车型。它包括独特的五辐17英寸合金轮毂、带灰色嵌件和前座椅SAAB压花的黑色皮革运动座椅、深色胡桃木饰板、带灰色镶边的黑色脚垫、前雾灯以及带6碟CD换碟机和卫星广播的BOSE音响系统。轿车和敞篷车型还配备了行李箱盖扰流板。该版本提供冰蓝色金属漆以及标准SAAB油漆颜色。
Saab声称2008款车型进行了超过2000项更改。2007年6月10日在瑞典Trollhättan的Saab节上推出，2008款车型包括受Saab Aero-X和Saab 9-2X启发的新前脸造型、Saab首次在改进的大灯中使用LED'签名'照明、新门板、新蛤壳式引擎盖、新后保险杠和透明尾灯，被称为'冰块'。黑色取代炭灰色成为内饰颜色选择。Snow Silver成为新的外观颜色。2.8T V6的输出从250马力提升至255马力（184千瓦至188千瓦；247马力至252马力）。一些额外的外观修改可在限量版XWD、280马力（206千瓦；276马力）9-3 Turbo X上获得，该车在法兰克福车展（9/07）上展出。Turbo X于11月下旬在新英格兰车展上首次在北美亮相。Saab还于2008年3月发布了Aero的全轮驱动版本，该系统被称为'XWD'。
一款新的双涡轮增压柴油发动机，功率180马力，被称为1.9 TTiD，被引入。TTiD发动机也提供Aero配置。TTiD Aero标志着Saab首次在带有Aero名称的汽车中使用柴油发动机。
Turbo X提供运动轿车或Sportcombi（旅行车）车身样式，旨在庆祝Saab涡轮增压30周年。所有Turbo X车型均提供金属喷气黑色，带有哑光灰色装饰。Turbo X是Saab首款配备来自Haldex Traction和eLSD的XWD全轮驱动系统的量产车。它由一台2.8升V6发动机提供动力，产生280马力（206千瓦），匹配六速手动或自动变速箱。它拥有更大的制动器以及更硬的弹簧和减震器。仪表板、换挡杆和门板具有碳纤维外观，涡轮增压表的设计灵感来自Saab 900。
2009年9-3系列扩展了配置级别，同时从阵容中取消了限量版Turbo X轿车和旅行车。2.0T和Aero轿车及旅行车车型现在提供Saab的全轮驱动（XWD）。敞篷车系列缺乏全轮驱动选项。2009年9-3与2008款车型基本相同，尽管Aero配置级别标配XWD系统、eLSD和280马力动力提升，这些以前仅用于已停产的Turbo X。2009年，9-3X在日内瓦车展上推出。9-3X是9-3 SportWagon的四轮驱动XUV版本。新款9-3X提供两种发动机选择：1.9升柴油发动机（产生180马力）和2.0升汽油发动机（产生210马力）。只有2.0升汽油发动机配备XWD，而柴油版本仅提供前轮驱动。
对于2010年，Saab 9-3 Aero的涡轮增压V6被取消。所有车型均使用2.0升涡轮增压四缸发动机。
2010年标志着Erik Carlsson在RAC拉力赛上驾驶Saab 96首次为Saab获胜的50周年。总共生产了96辆Aero Carlsson 9-3。9-3 Aero Carlsson配备了Saab的交叉轮驱动（XWD）系统，以及一台涡轮增压2.8升V6发动机，产生280马力（206千瓦）和400牛·米（295磅·英尺）的扭矩，通过6速'Sentronic'液压自动变速箱传递。它可以在6.9秒内从0加速到60英里/小时（97公里/小时），在6.3秒内从50加速到70英里/小时。
Saab 9-3 ePower电动汽车在2010年巴黎车展上作为Saab的电动汽车揭幕。该概念车基于9-3 SportWagon，配备35.5千瓦时锂离子电池组，最高时速150公里/小时（93英里/小时），估计续航里程200公里（120英里）。Saab计划在2011年底前在瑞典用70辆ePower示范车进行为期两年的试验。Saab庄园的新所有者National Electric Vehicle Sweden最初表示，他们计划在2013年底或2014年初在中国推出全电动9-3 ePower。
量产版计划在2014年法兰克福车展上揭幕，2015年上市。2014年4月，NEVS开始生产一批200辆，将于2014年中在中国青岛进行测试。测试后，销售计划于2015年在瑞典开始。
9-3在2011年针对2012款车型年进行了一些修订。变化在于发动机系列，柴油和汽油发动机的燃油消耗分别整体降低了12%和7%。为9-3轿车、旅行车和9-3X车型（配备Saab XWD）增加了一款入门级163马力2.0升汽油/BioPower发动机。其他变化包括与新款Saab 9-5轿车一致的后部徽章、'冰块'风格前大灯、新的前保险杠设计、仪表板、换挡杆、车门和手套箱周围的钛金属效果饰条。Aero包括石墨纤维效果和皮革内饰上的对比缝线。
在大多数市场，该车被标记为'Griffin'。三辐合金轮毂回归，提供16至18英寸选择。发布了一款'Independence Edition'敞篷车，总共生产366辆，以纪念出售给Spyker Cars一周年。其中只有37辆完成。[需要引用]
在Saab Automobile消亡和9-3退出市场后，经过大量改装、符合TTA – Racing Elite League规定的9-3在2012年TTA赛季以及2013年至2016年STCC赛季中进行了比赛。
注意：柴油、生物燃料和某些汽油发动机在北美不可用。从2004年底开始，柴油发动机是来自Fiat的共轨单元。
